W Kenii panuje klimat równikowy, co oznacza, że jest tam bardzo gorąco. Kraje równikowe charakteryzują się występowaniem pory deszczowej oraz pory suchej. Najkorzystniejszy klimat panuje na wybrzeżu, gdzie nie występuje pora sucha, a temperatury sięgają z reguły 30°C. Przez cały rok na wybrzeżu powietrze jest bardzo wilgotne i gorące, natomiast w październiku i maju odnotowuje się najwięcej opadów. Północna i Wschodnia Kenia są charakterystycznym przykładem klimatu pustynnego. Występuje tutaj najmniej opadów, a temperatury często przekraczają 30°C. W wysokich górach temperatury są znacznie niższe i osiągają zaledwie 18°C, w nocy spadają nawet do 0°C. Najwyższe szczyty pokryte są całorocznie śniegiem i lodem, przykładem tego jest Wyżyna Kenijska.